Actualmente, el BAE está compuesto por 54 organizaciones (fundaciones, cooperativas, asociaciones de productores, corporaciones de desarrollo sostenible, institutos de investigación, universidades, ONG, agencias internacionales de cooperación, organizaciones religiosas con trabajo territorial, organizaciones étnicas entre otras) que cuentan con el interés y las capacidades para operar recursos del Fondo Colombia Sostenible.